L’Institut Ausonius est une Unité Mixte de recherche (UMR 5607) du CNRS et de l’Université Michel-de-Montaigne Bordeaux 3.
Créée en 1996 par le regroupement en une seule structure de centres de recherches travaillant dans les domaines de l’Archéologie, de l’Histoire de l’Antiquité (mondes grec et romain) et du Moyen-Âge, elle fédère un ensemble de chercheurs du CNRS, d’enseignants-chercheurs de l’Université, d’ingénieurs, de personnel administratif et de doctorants. Son activité se déroule dans deux bâtiments placés sur le Domaine Universitaire à Pessac, la Maison de l’Archéologie qui a ouvert ses portes en 1992 et l’Archéopôle inauguré en 2005.
L’Institut Ausonius présente des programmes de recherches dans les domaines des sciences de l’antiquité, de l’histoire médiévale et de l’archéologie avec comme orientations principales le souci de l’innovation dans la réflexion historique ( par exemple autour de la place de l’économie dans les sociétés anciennes, de l’analyse des spectacles à la fois comme un fait social et culturel et comme un espace, du lien entre le territoire et l’histoire) et dans la technologie de l’image (restitution virtuelle des espaces et des bâtiments) , l’intégration dans la culture régionale de l’Aquitaine et un souci constant d’une grande ouverture à l’international à travers de nombreuses opérations archéologiques menées autour de la Méditerranée, de l’Espagne à la Syrie.